El programa tiene como objetivos principales:
- El fortalecimiento del AMARCY, ECA AMARAKAERI y ANECAP para la cogestión de la RCY y RCA, y un manejo inclusivo y participativo de los recursos naturales para el desarrollo sostenible de las CCNN y anexos colonos socios.
- La implementación de actividades económicas sostenibles bajo los acuerdos tripartitos de conservación de bosques y los acuerdos de vida plena articulados al PNCBMCC, los cuales disminuyen la deforestación y conservan las reservas comunales.